O mais indicado, é colocar as instalações sobrepostas. pois não afetaria em nada a estrutura da laje.
Porém eu já fiz instalações elétricas e hidráulicas em lajes nervuras na própria estrutura, nos locais das cubetas, colocava um tábua, ficava maciço de concreto uma parte, mas evitava as instalações sobrepostas.

Há também vários fatores de qual forma utilizar, depende do tipo de parede, pois se for paredes grossas, há maior possibilidade de variação da locação das mangueiras(eletroduto), mas se for Drywall, onde as paredes normalmente são de 9,5cm, há uma grande dificuldade de colocar as decidas dos eletrodutos.

A melhor forma, é passar entre a laje e o forro (Gesso, PVC ou outro) para unidades residenciais ou comerciais sendo previsto desde o início um pé-direito mais alto para o mesmo.

No caso de garagens ou unidades industriais, a instalação sobreposta acho que seria o mais apropriado.